plink

Plink是一款免费开源的用来分析全基因组的工具。

目前,已经更新了plink2

PLINK的重点是对基因型/表型数据的分析,因此不支持此前的步骤(例如,研究设计和计划,从原始数据生成基因型或CNV调用)。 通过与gPLINK和Haploview集成,可以为后续的可视化,注释和结果存储提供支持。

我个人认为用新不用旧,因此这里会用plink2。

plink2可以在这里下载。windows的版本是编译好的exe文件。

操作简单。

具体的操作命令,可参阅General usage

突出一个水字,因为时间不够用啦。