MitoMap是人类线粒体基因组数据库，除可以直接在线查询线粒体坐标的注释与相关文献研究外，还可以在线分析fasta序列（我没用过）。当然，最值得使用的方式是下载MitoMap提供的注释文件，形成自己的注释数据库。
MitoMap在线查询
MitoMap提供在线查询的接口，只要输入线粒体的起始终止位置，即输出其中包含的突变以及突变的注释信息。起始位置限制范围是1到16569，由此可见，如果我们使用的是UCSC的hg19参考基因组（chrM长度16571bp），与MitoMap的线粒体参考是不匹配的，而使用hs37d5、b37、GRCh37、GRCh38等则都能对得上。搜索能除了突变位点人群频率等信息外，还有参考文献以及MitoTIP、HmtVar、APOGEE等软件预测有害性。
MitoMap下载
MitoMap数据库下载页面中，提供了下载的api下载多个格式的数据以及MitoTip有害性预测得分，通过下载vcf格式等文件，可以很方便的解析为annovar等注释软件能使用的格式。