SNPedia

SNPedia是一个我挺喜欢用来搜snp信息的网站,它聚合了很多其他数据库的内容,很好用!

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举个栗子: rs671是一个比较热门的位点,和酒精有关。

rs671-01 左边是一个梗概性的描述,然后下面是很多的参考文献(PMID)。右边是这个位点,不同的基因型下不同的临床表现。

rs671-02 右边可以看到SNPedia引用的地方很多!我比较关注的是pharmgkb和23andme。

rs671-03 然后滚滚滚到下面,右下角是一个clinvar的注释,clinvar也是一个很重要的数据库。

以上就是snpedia的一个简单的rsid页面。

SNPedia还有一些搜索方式,比如搜一个HLA的分型,例如在风湿病中经常检测的HLA-B*27。 不截图了,自己进去看吧!