我想修改singularity的镜像sif文件中的一个脚本,然后形成新的镜像sif。问了下GPT,可以使用下面的操作。
构建沙盒
首先,需要从现有的.sif文件中提取内容。可以使用Singularity的singularity build命令来将.sif文件转换成可修改的目录或Sandbox。
singularity build --sandbox /path/to/sandbox old.sif
修改代码
进入到沙盒中,按需修改代码及文件。
cd /path/to/sandbox
vi script.sh
测试沙盒
可以通过shell进入沙盒进行测试,和进入sif是一样的
singularity shell --writable /path/to/sandbox
生成sif
将修改后的沙盒打包为新的sif,还有删掉临时文件
singularity build new.sif /path/to/sandbox
rm -rf /path/to/sandbox