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2024

11月18日尝试使用新的python包管理器uv
11月14日错义突变Z评分
11月11日部署FLUX和Forge
11月05日Docling简单使用
10月10日MNV/MNP合并
10月09日NAS折腾笔记
08月09日WES性别预测的奇技淫巧
08月01日我需要转到峰谷电价？
07月26日Pandas的SettingWithCopyError定位到行
07月18日NCCL 肿瘤生信室间质评
06月06日ChinaMAP数据库
05月31日外显子Bed文件制作
05月29日小米摄像头储存到nas
05月17日修改并更新singularity的sif镜像
05月16日评估WES流程SNP/INDEL检测准确率
04月09日适配于LSF集群的WDL配置
04月02日接近肿瘤或WES的VEP注释的完美状态？

2023

12月31日2023总结
11月26日complexHeatmap 瀑布图
10月11日ggplot2绘制三角热图
10月10日fisher精确检验
10月09日WordWriter，python自动化Word报告
09月13日maftools瀑布图上侧柱形图改为Multi Hits
09月03日python几种统计方法
08月14日爬取oncokb
06月25日python脚本加密和文本加密
06月15日邮件相关
04月19日使用paramiko上传和下载sftp数据
03月26日Stable Diffusion
03月25日mysql安装
03月06日pymol开源版安装
02月06日低样本量下的测序barcode选择
01月22日认真调研认真攻略

2022

12月31日2022总结
12月23日python自动导出腾讯文档excel表格
11月30日SMA分析初探
10月21日NIPT麻木再来一遍
09月18日还好，这次没被封
08月27日MC3数据集TMB浅度分析
08月10日pipenv环境打包python程序
07月20日delly安装和使用
06月25日家庭网络拓扑
06月09日挑选一批SNP位点用于分析污染
05月30日VEP安装和使用
05月24日WDL流程中导入文件夹
05月17日外显子bed
05月02日建立snpEFF的线粒体注释库
04月03日医保相关靶向药物位点
02月18日乳腺癌21基因复发评分
02月17日CNVnator和CNVpytor的使用
02月16日CNVkit分析WGS
02月10日TMB笔记
01月25日Control-FREEC的使用
01月07日WisecondorX的使用

2021

12月31日2021总结
12月24日尝试用playwright写爬虫
12月02日NIPT
11月26日SKlearn LinearSVC
11月08日爬取OMIM数据库
10月22日GATK 检测 Germline CNV
10月20日ExomeDepth检测CNV
10月10日XHMM检测CNV
09月23日MitoMap 数据库
08月30日参考转录本
08月22日再整理一次测序数据去重流程
08月20日GATK PoN相关
08月04日UMI去重强行MarkDuplicates
07月12日IWPC华法林剂量公式
06月30日seeksv安装和使用
06月28日Singularity 安装和使用
06月21日亲子鉴定相关分析
06月11日短串联重复序列 STR 分析
06月10日同源重组修复缺陷HRD 分析
06月07日WordWriter，自动化Word报告生成的python脚本
05月29日果然我不适合做实验
05月28日Cromwell GUI
05月19日WDL学习笔记
05月15日Docker WDL Snakemake学习
04月25日lohhla检测HLA区域LOH
04月19日sambamba与varscan2的使用
04月15日怎么规范写突变
04月14日HLA分型软件Optitype
04月13日爬取DECIPHER Genomics数据库
04月08日HLA区域reads提取
03月26日尝试接近illumina TSO500 分析流程
03月18日爬取CHPO数据库
03月09日爬取CKB数据库
03月05日根据转录本号找内含子
02月28日UMI的处理
02月11日oculus quest2 流程与感想
01月31日oculus quest2激活
01月11日2021先开个头

2020

12月31日2020总结
11月19日KataGo和Sabaki安装（Windows版本）
11月12日B450i主板换ax200网卡
10月13日双十一配置升级方案
08月26日WSL用ubuntu20.04好了
07月20日统计Bam文件单个位点碱基比例
07月16日使用HLA-HD进行HLA分型
06月09日一些癌症相关panel
05月26日sklearn ROC与AUC曲线
05月22日sklearn 鸢尾花
05月15日探针设计软件mrbait
05月11日随机森林
04月30日才发现bedtools intersect -v是这样的
04月28日ubuntu 新硬盘组raid
04月09日使用bam2raster输出类似IGV的截图
03月26日shannon指数的python实现
03月24日从OTU矩阵到Observed_species稀释曲线
03月05日weka（四舍五入就算是会机器学习了吧）
02月11日多序列比对
01月21日新型冠状肺炎病毒
01月15日根据转录本编号，提取ensembl的cdna序列
01月08日还是来更新一下clinvar吧

2019

12月31日2019总结
12月24日MSI检测panel
11月27日InSiGHT
11月12日探针设计软件catch
11月11日记双十一眼镜方案
10月22日《塞尔达传说：荒野之息》通关感想
10月15日微卫星不稳定检测，NGS可用软件
10月12日bam文件转为fastq
10月05日去中大眼科中心验光
09月29日国庆画个国旗
09月19日weka
09月04日SV分析
09月02日CNV分析
08月28日ncbi的genotyping tool
08月05日去除bam文件中的clipped reads
07月31日ML 100 Days （4-6）
07月30日WordWriter，一个用来填docx模板的模块
07月22日服务器进入grub
07月19日服务器进入initramfs
07月04日找外显子区域和内含子区域
06月27日DNA序列转成氨基酸序列
06月21日截断引物的需求
06月12日个人癌症报告生成器
06月11日ML 100 Days （3）
05月21日DECoN的安装，检测外显子缺失
05月14日ML 100 Days （2）
05月10日目前的配置与升级方向
05月08日ML 100 Days （1）
05月05日画个散点图
04月16日下载TCGA的数据
04月09日找启动子
03月30日只狼天下第一
03月20日NIPT
03月11日用bedtools统计深度和覆盖度
03月05日bamdst统计测序结果质量值
02月27日samtools是真的好用啊，要灵活使用各种flag和tag
02月15日SAM/BAM文件
02月13日下载ncbi的sra数据v2
01月28日宏基因组，除去宿主序列
01月27日WSL怎么用docker
01月27日这才是conda的正确姿势
01月26日在家里玩就用WSL
01月13日加权共表达网络分析WGCNA
01月01日PCA图

2018

12月31日2018总结
12月26日R包biomaRt
12月11日用shell命令统计fastq的reads数
12月11日root登录ubuntu的图形界面
11月16日韩国人基因组计划KPGP
10月19日柱状图，PCA图，系统发育树
10月08日plink
09月29日win10 windows defender 无法启动
09月20日精神分裂症GWAS
09月13日用cufflinks统计RPKM值
09月07日scRNA-seq分析
08月30日ggplot2画GO注释的条形图
08月27日用homer来找motif
08月22日ChIP-seq基本流程
08月21日ChIP-seq报告简单模板
08月20日质控、去接头、剪裁一体的软件fastp
08月18日扩增子流程以及复现文章（1）
08月18日扩增子流程以及复现文章（2）
08月18日扩增子流程
08月17日对WGS/WES数据判断性别
08月14日16S报告简单模板
08月10日RNA-seq报告简单模板
08月09日用edgeR做差异分析
08月05日外显子报告简单模板
08月04日又一个QC软件，qualimap
07月31日扩增子(3)：qiime2
07月27日annovar的官方clinvar数据库格式修改教程
07月26日扩增子(2)：phyloseq画图
07月25日扩增子(1)：DADA2流程
07月24日qiime2，扩增子分析平台
07月23日安装docker
07月20日统计fastq中每个读长的counts数
07月18日RNA-seq(4)：Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图！
07月12日RNA-seq(3)：Hisat2+HTSeq+DESeq2流程
07月10日RNA-seq(2)：Hisat2+Stringtie+Ballgown流程
07月08日RNA-seq(1)：所需软件和数据库
07月06日关于gatk4的一个事实！
07月02日用iTools来统计下机数据质量值
06月28日使用在线的sift
06月28日UCSC在线对vcf进行注释
06月26日新建用于annovar的cosmic数据库
06月22日gatk BQSR为啥跑不通！
06月10日jax-ckb体细胞变异数据库
05月26日跟着做一个RNA-seq
05月17日有感
05月13日弄了个孟德尔遗传病的panel
05月03日GO/KEGG 富集分析
04月25日把clinvar转换成annovar可用的格式
04月18日用VVP分析一下致病位点看看
04月13日知道RSID，怎么得到在染色体上的位置
04月02日通过OMIM做一个癫痫panel
04月01日GATK4推荐的call生殖细胞突变流程（脚本）
03月26日GATK4推荐的call体细胞突变流程（脚本）
03月23日GATK4推荐的数据预处理（脚本）
03月14日用seq2HLA做HLA分型
03月11日下载NCBI的SRA数据
02月13日GATK推荐的找体细胞突变流程
02月11日已知PMID，得到参考文献的格式
01月27日GATK推荐的germline call snp+indel流程
01月19日GATK推荐的数据预处理流程
01月11日从TCGA中获得甲状腺癌的相关突变
01月03日多序列比对软件mafft

2017

12月21日建立阿尔兹海默病的panel
12月18日使用Transvar来找位点
12月07日建立阿尔兹海默病的数据库
11月30日新手组装电脑注意事项
11月25日用Exomiser筛选致病基因
11月24日关于注释之后怎么进行基本的筛选
11月15日只知道位点，怎么查询到rsid
11月14日GATK流程
11月07日生信懂得简单的linux就可以啦（4）
10月30日肿瘤体细胞基因突变高通量测序(1)
10月20日生信懂得简单的linux就可以啦（3）
10月18日生信懂得简单的linux就可以啦（2）
10月17日生信懂得简单的linux就可以啦（1）
10月09日yaml
09月29日放个假！
09月25日用R处理ab1数据
09月23日HLA分型与资料数据库
09月22日annovar
09月21日B-L-A-S-T!blast
09月20日连金鱼都能看懂的git简明教程！
09月19日Chromas
09月18日SNPedia
09月17日药物基因组学知识库PGKB
09月17日什么是SNP
09月16日github建立博客！
09月15日Hello world!
09月15日Picture Test!

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