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可视化

虽然说是可视化,但是实际只是简单介绍IGV这个软件而已。IGV全称Integrative Genomics Viewer,也是Broad研究所的一款软件。在进行了上述的检测得到阳性结果后,常规流程下都需要去IGV看看这个位点的情况,如果是遗传方面的阳性致病位点,更是需要使用一代测序去做父母子验证。想要深入学习建议去看IGV的document,写的很详细。

基础

IGV

1 工具栏

2 红框表示显示的染色体位置

3 反应染色体位置和碱基数

4 IGV在轨道中水平显示数据

5 基因特征

6 样本名称

7 属性名称,可按属性进行排序

插入位点颜色

按插入长度设置颜色

insert

甲基化

甲基化模式

bs