2026新坑开挖-开源NGS临床分析平台

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项目地址:schema-platform

项目包含“遗传全外显子分析平台”以及“实体瘤泛癌种分析平台”(暂不考虑血液瘤,比较复杂)。

Apache 2.0许可开源。

这个项目我预估会使用2026年全年的业余时间来打磨。

持续进化中,演示页入口

前端

项目前端整体采用NextJs进行构建,数据的对接使用Parquet格式

整体采用类Github的风格

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UI上,会找点人脉继续聊聊,从使用方的感受来进一步打磨

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后端

整体采用Go语言建立后端,提高效率,降低资源损耗。

分析流程

采用Nextflow建立。所有流程和软件均采用docker进行封装,用docker-in-docker的方式运行。开源版本的数据库使用公共数据库,同时我自建一个订阅数据库(我的盈利点)。

当前的思路是,用户可以在这个前端自行导入,通过配置VEP参数达到加入自己注释的效果

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定制化报告

每个分析任务最终都会产生一个Parquet文件(包含所有的样本信息、检出报表、文件路径等内容),用户可以自行以Restful API构建自己的报告生成端点,对接到系统中。

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