BioTools超进化

#software

BioTools经过持续的迭代,现在拥有了更多的工具。

一开始,BioTools的初衷是所有工具都是在本地进行运算的,所有信息都不会离开你自己的电脑。但是,实际情况是,我们增加了下面这些工具,会向外部服务器发送信息。当然,在这些工具页面里,我们都著名了请求将被发送到外部服务器。

BioTools仍然提供着在线使用的方式。

向外请求

首先是Mutalyzer,这是一个将HGVS变异描述验证、标准化、格式转换和序列映射的工具。请求会被发送到Mutalyzer官方,然后根据返回结果,自行渲染。

然后是剪接位点有害性预测工具,这个工具可以使用SpliceAI和Pangolin模型预测变异对剪接位点的影响,支持GRCh37和GRCh38。请求将被发送到博德研究所的SpliceAI Lookup。

跳转

当然,现在BioTools还包含了下面三个外部工具的跳转。

  1. ManeLoca,这会跳转到我编写的MANE转录本坐标查询器
  2. DeepHPO,这会跳转到我编写的基于LLM的病历信息HPO术语提取
  3. DeepHPO,这会跳转到我编写的华法林剂量计算器

实验性更新

BioTools现在加入了Page Agent,可以以自然语言的方式,进行完整的页面操控。