结果可视化

使用pavian进行结果可视化。

Pavian可以方便的对Kraken2，Centrifuge和MetaPhlAn的宏基因组学分类结果进行可视化，是一个非常不错的下游工具。

pavian使用R编写，所以一般以shiny app或docker的方式打开，再将kraken2或centrifuge的结果报告导入就可以了。

首先是质量报告，查看比对的各个类型的reads。centrifuge的结果比kraken2的回报结果少了很多。

以上则是我们最关注的报告，本次分析成功获得了SARS-related Coronavirus的结果。

最后则是一个发育树。