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Chromas是一款用来处理/查看 Sanger测序的下机数据(*.ab1文件)的软件。界面简单看起来舒服。 下面介绍使用方法： 打开软件，Open你想要查看的ab1文件。 比如，我打开的是rs1127354这个位点的Sanger测序下机数据。通过到NCBI搜索，可以得到这个位点的前后序列。 CTAGGAGATAAGTTT[C]CATGCACTTTGGTGG 复制后面的一段： CATGCACTTTGGTGG 然后在chromas中搜索 注意这里，最下面的85%是设定的相似程度，如果需求的是100% match，就选择match exactly。 找出来之后的结果。 可以看到，前后序列对应之后，我们要找的SNP位点，同时有蓝色和绿色两个峰，所以判读为杂合子：CA。 如...

SNPedia是一个我挺喜欢用来搜snp信息的网站，它聚合了很多其他数据库的内容，很好用！ 主页： Snpedia 举个栗子： rs671是一个比较热门的位点，和酒精有关。 左边是一个梗概性的描述，然后下面是很多的参考文献（PMID）。右边是这个位点，不同的基因型下不同的临床表现。 右边可以看到SNPedia引用的地方很多！我比较关注的是pharmgkb和23andme。 然后滚滚滚到下面，右下角是一个clinvar的注释，clinvar也是一个很重要的数据库。 以上就是snpedia的一个简单的rsid页面。 SNPedia还有一些搜索方式，比如搜一个HLA的分型，例如在风湿病中经常检测的HLA-B*27。 不截图了，自己进去看吧！

这是个非常简单又非常重要的东西，经常会遇到！ 我记得我去面试的时候，就被问了这个问题：什么是SNP。 我：不知道！ 然后就过了面试。 SNP全称是Single Nucleotide Polymorphisms（单核苷酸多态性）。按照我的理解，就是单个碱基的变异（转换、颠倒、缺失、插入）。 然后！每个SNP，都有相对应的‘rsid’，中文我们喊‘rs号’。rsid是NCBI给每个SNP的编号，别的数据库也有他们自己对于SNP的编号，不过因为NCBI是现在最常用的数据库，所以一般以rsid为准！ 常用的查询SNP的地方：dbSNP 百科解释： 维基百科 百度百科

PharmGKB是一个把药物、SNP、基因联系起来的数据库。有很多常见的药物，但是比较偏门的会没有！不过其实一般来说已经够用。 点击PGKB进入！ 这是PGKB的新版主页： 建议点右上角注册一个账号，因为有很多信息要登陆了才给看！ 在搜索框，可以搜索_rsid_，基因名字，药物名字（英文名啦）。也可以同时搜索这些来缩小范围！ 例如：搜一下阿司匹林。 可以看到，有clinical annotations和variant annotations。 在clinical annotations这里，level可以说是靠谱的等级，最高的是Level 1A，最低貌似是Level 4。然后后面需要是MOLECULE（药物），TYPE（类型），PHENOTYPE（致病类型）这些，点...

事情是这样的，前几天，我想着利用github page建一个博客。由于零基础，我google了很多教程。但是！都不好用！因为他们都过时了！我发现，现在用github建博客非常简单！根本不像那些教程做的那么复杂！当然，如果你要很炫很折腾的那种，就去看那些教程。下面来说说我的教程。 第一步，因为是github博客，一个github账户是必须有的。点击github进去，注册一个账户。有了账户之后，点击如下位置，新建一个仓库（repository）。 第二步，按下面新建一个仓库，仓库名是username.github.io。注意username改成自己的名字！ 第三步，安装github desktop，安装过程略，装好之后登录你的github账户，ctrl+shift+O，然后选择...

这是一篇测试文章，TEST，~test~ testing java test public class HelloWorld { public static void main(String[] args) { System.out.println('Hello World!'); } } python test print 'Hello World!'