CNVkit分析WGS

[CNVkit](https://cnvkit.readthedocs.io/en/stable/)一般用来分析肿瘤样本的拷贝数变异(使用配对样本或者正常样本建立参考基线的)。实际上,CNVkit也提供了全基因组胚系CNV分析的方法。

TMB笔记

肿瘤突变负荷(Tumor Mutational Burden,TMB)为肿瘤基因组区域中每兆碱基(Megabase,Mb)发生的碱基替换突变 和插入缺失突变的数量总和,单位为 muts/Mb。

Control-FREEC的使用

[Control-FREEC](http://boevalab.inf.ethz.ch/FREEC/index.html)是一款广受好评的WGS、WES数据CNV检测软件。