ncbi的genotyping tool
之前做HBV的分型的时候,发现ncbi有这个分型的工具,[genotyping tool](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genotyping/help.html)。原理是使用blast将query序列与设定好的blast库进行blast获得最相似的序列。
去除bam文件中的clipped reads
bam文件里面会存在soft clipped 和 hard clipped等结果,有时我们只需要完美匹配结果,可以对bam文件进行处理。(当然,也可以在比对时就设定相关参数,比如bowtie2的end-to-end)
ML 100 Days (4-6)
跟着大佬学习一下机器学习[100-Days-Of-ML](https://github.com/MLEveryday/100-Days-Of-ML-Code)。