从OTU矩阵到Observed_species稀释曲线

这里是Observed species 稀释曲线的获得方法。它是利用已测得16S rDNA序列中已知的各种OTU的相对比例,来计算抽取n个(n小于测得reads序列总数)reads时出现OTU数量的期望值,然后根据一组n值(一般为一组小于总序列数的等差数列)与其相对应的OTU数量的期望值做出曲线来。

多序列比对

以前上课的时候,老师教我们用的是EMBL的在线的[Clustal Omega](https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/),现在试试自己搭一套。