得到一个需求，截断fastq里的引物序列，为什么是截断而不是去除，目的是为了交付数据时不被同行得到引物同时读长看起来也没那么短。一开始想象中是很简单的，只要替换fastq中的引物序列就好了，但是后来发现有些目标区域其实也含有引物的序列，如果直接替换了会导致这些目标区域变成缺失之类的判读。

[Personal Cancer Genome Reporter (PCGR)](https://github.com/sigven/pcgr)，作者是挪威奥斯陆大学癌症研究所的。感觉是进行了大量的工作，把各个数据库以及软件搭建了在一起，并且最终生成了一个阅读性极高的html报告。

跟着大佬学习一下机器学习[100-Days-Of-ML](https://github.com/MLEveryday/100-Days-Of-ML-Code)。

[DECoN](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5409526/)是一款可以检测panel外显子缺失的R语言软件，使用的时候也是遇到一些问题，不过总体上还是挺好用的。[DECoN](https://github.com/RahmanTeam/DECoN)可以在github下载。

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