尝试使用新的python包管理器uv

最近在网上冲浪时(🚽玩📱),发现很多人说抛弃垃圾conda,不要再用龟速pip,改用[uv](https://github.com/astral-sh/uv)。总得来说,uv的优势的速度极快,劣势是成熟度和生态还不如pip和conda。

部署FLUX和Forge

AI发展真的很快,一年多的时间,[Stable Diffusion](https://pzweuj.github.io/2023/03/26/Stable-Diffusion.html)的热度已被[FLUX](https://blackforestlabs.ai/get-flux)打了下去。尝试一下现在的破电脑(RTX 2070,8G VRAM,16G RAM)能不能本地部署,感觉有点悬。不过可以...

Docling简单使用

日常工作中,会有从docx文件或者pdf文件中提取信息的需求。一般的,在提取docx时,我是用的是[python-docx](https://python-docx.readthedocs.io/en/latest/)库;而提取pdf时,使用的是[PyPDF2](https://pypdf2.readthedocs.io/en/3.x/)。

MNV/MNP合并

肿瘤的变异检测一般用到Mutect2,但Mutect2对MNV的检出支持并不好,而EGFR基因的19del突变是经常有MNV的情况出现,这种19del通常被拆分为一段del和一个SNV,一般会用[transvar](https://bioinformatics.mdanderson.org/transvar/)、[mutalyzer](https://mutalyzer.nl/)来人工重注释,显然...